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So bestimmen Sie fwhm in der ursprünglichen Position

Hallo, das ist mein erster Beitrag. Ich habe in den Foren nachgesehen und keine ähnliche Frage gesehen. Ich bekomme eine schöne Kurve, aber wenn ich FWHM durch Zeichnen eines Liniensegments und Messen messe, erhalte ich Zahlen, die nicht zu meiner Skala passen. Kennt jemand ein gutes, alternatives Plugin für die FWHM-Analyse? Google hat hier nicht viel geholfen. Oder kennt jemand eine Lösung für mein Skalierungsproblem?

Willkommen im Forum tcurry! Haben Sie eine logarithmische Skala, eine Achse mit negativen Werten oder ein Bild mit kalibrierten Intensitäten? Sie können dies testen, indem Sie ein Diagramm erstellen. E. Ein Screenshot kann ebenfalls hilfreich sein.

Ich habe ein Bild mit kalibrierten Intensitäten und Längen von Lecia. Ich habe das Problem sowohl mit dem Linienprofil-Tool als auch mit dem BAR-Mehrkanal-Analyse-Tool reproduziert. BAR-Analyse. Das beigefügte Bild zeigt meine Schätzung von FWHM auf den grünen Kurven und, wie Sie sehen können, die Werte von 9 und 6. Die Koordinaten werden jedoch gemäß der Skala und Kalibrierung Ihrer Originaldaten angegeben.

Ich fürchte, Sie benötigen ein Makro, um die Linienlängen in Mircons zu erhalten, und dieses Makro sollte auch die Linien korrekt positionieren, um Ihnen die gewünschte FWHM zu geben. Meiner Meinung nach sind die derzeit gezogenen Positionen fraglich. Screenshot 2018-02-20 um 11.

Ähnlich wie bei Emartini kann ich dies auch nicht reproduzieren. Die Tatsache, dass das Problem auch bei integrierten Tools auftritt, deutet darauf hin, dass das Problem bei IJ selbst liegt oder dass Ihre Lebensdatei etwas Seltsames aufweist.

Ich würde Folgendes vorschlagen: Versuchen Sie es mit einem Emartini-Vorschlag: Wenn das Problem mit dem Beispielabbild der Confocal Series auftritt, ist das Problem auf Ihre Installation beschränkt.

Andernfalls wäre es nützlich, Zugriff auf diese bestimmte Lebensdatei zu haben. Können Sie sie irgendwo platzieren, wo wir sie herunterladen können? Ich glaube, ich habe richtig erklärt, was in meinem vorherigen Beitrag passiert ist. Entschuldigung für das Rauschen, ich erinnerte mich an diesen Thread, der sich jedoch mit einem etwas anderen Problem befasste. Vielen Dank für Ihre Hilfe. Ich spielte noch etwas mit dem Bild und stellte fest, dass das Problem darin bestand, dass meine Linien von Hand gezeichnet und nicht perfekt parallel zur Achse waren. Es scheint, dass jede geringfügige Abweichung von der Senkrechten in der Länge vergrößert wird.

Ich habe einige FWHM-Plugins ausprobiert, aber sie waren spezifisch für Dinge wie das Zählen von Lochphotonen und haben mit meinen Daten nicht gut funktioniert. Wenn jemand irgendwelche Vorschläge hat, würde ich mich freuen. Ansonsten vielen Dank für all Ihre Hilfe bis zu diesem Punkt.

Der Grund, warum Ihre handgezeichnete Linie erweitert wird, wenn sie nicht horizontal gezeichnet wird, sind die großen Werte der kalibrierten vertikalen Achse. Ja, dieser Basiswert ist das nächste, was ich herausfinden muss. Aufgrund des Hintergrundsignals ist es subjektiv, die Grundlinie dieser Kurven zu erhalten. Ich dachte daran, aus dem Trog zwischen den Kurven zu gehen, da er theoretisch offen sein sollte, damit seine Intensität wahrscheinlich nur aus Signalblutungen besteht.

Es ist auch nur ein guter allgemeiner Punkt zu verwenden. Stimmen Sie mit anon96376101 überein. Wenn Sie jedoch überzeugt sind, dass Sie nur orthogonale Linien benötigen, müssen Sie einfach die Umschalttaste gedrückt halten, während Sie eine gerade Linie zeichnen.

Wenn das Problem im Grunde genommen gelöst ist, ist es etwas spät, aber Sie könnten interessiert sein zu wissen, dass Sie FWHM mit den integrierten Tools von Fidschi ziemlich einfach berechnen können, im Grunde genommen mit getProfile und Fit. Hallo, ich habe ein Bild mit kalibrierten Intensitäten und Längen von Lecia. Guten Tag, Sie messen die Linienlängen in der Grafik, die eigentlich ein Bild ist. Daher sind die Ergebnisse Ihrer Längenmessungen in Pixel angegeben. Grüße Herbie. Alles Gute Herbie. Bester Herbie. Danke noch einmal.

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